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微生物代谢国重室
生命科学技术学院
上海交通大学
生物信息学
 
研究人员    People
   工作人员
白林泉
教授
微生物功能基因组学,抗生素生物合成与调控
Email: bailq@sjtu.edu.cn
主要从事抗肿瘤安丝霉素、抗水稻纹枯病井冈霉素等的生物合成机理研究、合成生物学结构改造和功能基因组研究,在PNAS、JACS、NPR、Chemistry & Biology等杂志发表五十多篇研究论文。研究成果被Nature Biotechnology、Nature China、Faculty of 1000 Biology等专文评价,获得06年“中国高等学校十大科技进展”、07年“教育部自然科学二等奖”和08年“国家自然科学二等奖”。承担和参加了多项国家自然科学基金、863、973计划项目。曾入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”、上海市“曙光人才计划”,获得“中国青年科技奖”和“上海青年科技英才提名奖”。
教育经历:
    1988-1992年,山东大学,微生物学系,本科/学士
    1992-1995年,华中农业大学,生命学院,研究生/硕士
    1995-1998年,华中农业大学,生命学院,研究生/博士
工作经历:
    1999-2002年,University of Washington,化学系,博士后
    2002-2007年,上海交通大学,生命科学技术学院,副教授
    2008-至今,上海交通大学,生命科学技术学院,教授
荣誉奖励:
    第十一届中国青年科技奖, 国家自然科学二等, 教育部自然科学二等奖
    教育部中国高等学校十大科技进展, 上海青年科技英才提名奖, 明治乳业生命科学奖
人才计划:
    教育部新世纪优秀人才支持计划, 上海市曙光人才计划
社会任职:
    中国微生物学会分子微生物学与生物工程专业委员会副主任委员
    中国遗传学会微生物遗传学专业委员会副主任委员
    中国微生物学会基础微生物学专业委员会委员
    Biotechnology and Applied Biochemistry编委会委员
    《微生物学报》编委员会委员
研究方向:  微生物功能基因组学,抗生素生物合成与调控
 
 Figure 1. Genomic and transcriptomic insights into the thermo-regulated biosynthesis of validamycin in Streptomyces hygroscopicus 5008. [Wu, et al. BMC Genomics, 2012]
 Figure 2. Dual carbamoylations on the polyketide and glycosyl moiety by Asm21 result in extended ansamitocin biosynthesis. [Li, et al. Chemistry & Biology, 2011]
 
 Figure 3. Alternative epimerization in C7N-aminocyclitol biosynthesis is catalyzed by ValD, a large protein of the vicinal oxygen chelate superfamily. [Xu, et al. Chemistry & Biology, 2009]
代表性论文:
18. Tan GY, Bai L*, Zhong JJ*. Exogenous 1,4-butyrolactone stimulates A-factor-like cascade and validamycin biosynthesis in Streptomyces hygroscopicus 5008. Biotechnol Bioeng. 2013 May 23. doi: 10.1002/bit.24965.
17. Wu H, Qu S, Lu C, Zheng H, Zhou X, Bai L*, Deng Z. Genomic and transcriptomic insights into the thermo-regulated biosynthesis of validamycin in Streptomyces hygroscopicus 5008. BMC Genomics. 2012, 13:337.
16. Zheng L, Zhou X, Zhang H, Ji X, Li L, Huang L, Bai L*, Zhang H*. Structural and functional analysis of validoxylamine A 7'-phosphate synthase ValL involved in validamycin A biosynthesis. PLoS One. 2012, 7(2):e32033.
15. Li Y, Zhao P, Kang Q, Ma J, Bai L*, Deng Z. Dual carbamoylations on the polyketide and glycosyl moiety by asm21 result in extended ansamitocin biosynthesis. Chem Biol, 2011, 18(12):1571-80.
14. Kang Q, Shen Y, Bai L*. Biosynthesis of 3,5-AHBA-derived natural products. Nat Prod Rep, 2012, 29(2):243-63.
13. Jiang C, Wang H, Kang Q, Liu J, Bai L*. Cloning and characterization of the polyether salinomycin biosynthesis gene cluster of Streptomyces albus XM211. Appl Environ Microbiol, 2012, 78(4):994-1003.
12. Zhou X, Wu H, Li Z, Zhou X, Bai L*, Deng Z. Over-expression of UDP-glucose pyrophosphorylase increases validamycin A but decreases validoxylamine A production in Streptomyces hygroscopicus var. jinggangensis 5008. Metab Eng, 2011, 13(6):768-76.
11. Kang Q, Bai L*, Deng Z. Toward steadfast growth of antibiotic research in China: from natural products to engineered biosynthesis. Biotechnol Adv, 2012, 30(6):1228-41.
10. Qiu J, Zhuo Y, Zhu D, Zhou X, Zhang L, Bai L*, Deng Z. Overexpression of the ABC transporter AvtAB increases avermectin production in Streptomyces avermitilis. Appl Microbiol Biotechnol, 2011, 92(2):337-45.
9. Wu Y, Kang Q, Shang G, Spiteller P, Carroll B, Yu TW, Su W, Bai L*, Floss HG. N-methylation of the amide bond by methyltransferase asm10 in ansamitocin biosynthesis. Chembiochem, 2011, 12(11):1759-66.
8. Wu Y, Kang Q, Shen Y, Su W, Bai L*. Cloning and functional analysis of the naphthomycin biosynthetic gene cluster in Streptomyces sp. CS. Mol Biosyst, 2011, 7(8):2459-69.
7. Wu Q, Liang J, Lin S, Zhou X, Bai L*, Deng Z, Wang Z*. Characterization of the biosynthesis gene cluster for the pyrrole polyether antibiotic calcimycin (A23187) in Streptomyces chartreusis NRRL 3882. Antimicrob Agents Chemother, 2011, 55(3):974-82.
6. He Y, Sun Y, Liu T, Zhou X, Bai L*, Deng Z. Cloning of separate meilingmycin biosynthesis gene clusters by use of acyltransferase-ketoreductase didomain PCR amplification. Appl Environ Microbiol, 2010, 76(10):3283-92.
5. Xu H, Zhang Y, Yang J, Mahmud T*, Bai L*, Deng Z. Alternative epimerization in C7N-aminocyclitol biosynthesis is catalyzed by ValD, a large protein of thevicinal oxygen chelate superfamily. Chem Biol, 2009, 16(5):567-76.
4. Zhang Y, Bai L*, Deng Z. Functional characterization of the first two actinomycete 4-amino-4-deoxychorismate lyase genes. Microbiology, 2009, 155(Pt7):2450-9.
3. Zhou Y, Meng Q, You D, Li J, Chen S, Ding D, Zhou X, Zhou H*, Bai L*, Deng Z. Selective removal of aberrant extender units by a type II thioesterase for efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. strain FR-008. Appl Environ Microbiol, 2008, 74(23):7235-42.
2. Xu H, Yang J, Bai L*, Deng Z, Mahmud T*. Genetically engineered production of 1,1'-bis-valienamine and validienamycin in Streptomyces hygroscopicus and their conversion to valienamine. Appl Microbiol Biotechnol, 2009, 81(5):895-902.
1. Zhao P, Bai L*, Ma J, Zeng Y, Li L, Zhang Y, Lu C, Dai H, Wu Z, Li Y, Wu X, Chen G, Hao X, Shen Y*, Deng Z, Floss HG. Amide N-glycosylation by Asm25, an N-glycosyltransferase of ansamitocins. Chem Biol, 2008, 15(8):863-74.

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